计算机软件著作权的保护期限如下‌：

自然人软件著作权：保护期限为自然人终生及其死亡后50年，截止于自然人死亡后第50年的12月31日。如果是合作开发的软件，保护期限截止于最后死亡的自然人死亡后第50年的12月31日‌。

‌法人或其他组织软件著作权：保护期限为50年，截止于软件首次发表后第50年的12月31日。如果软件在开发完成后50年内未发表，则不再受著作权法保护‌。

计算机软件著作权的申请流程包括以下步骤‌：

‌填表‌

提交申请文件

‌受理

‌审查

‌领取证书