申请计算机软件著作权的流程可以分为以下三个步骤：

受理与审查 ：

著作权登记文件初步审查通过后，版权保护中心会受理申请。

版权保护中心会根据《计算机软件保护条例》和《计算机软件著作权登记办法》的规定进行审查，审查通过的，予以登记；不符合规定的，发放补正通知。

填表 ：

在中国版权保护中心的网站上填写计算机软件著作权登记的申请表，并打印出来盖章或签字。

提交书面材料 ：

向中国版权保护中心提交申请文件，包括盖章的申请表、申请人的主体资格证明资料（如营业执照副本或个人身份证复印）、计算机软件源代码的前30页和后30页（如果不足60页，则全部提交）以及权属明材料等。

建议：

在申请过程中，确保所有材料的真实性和完整性，并按照要求提交。

如果审查过程中有任何问题或需要补正，及时响应并按照规定进行补正，以确保申请的顺利进行。