在EDI许可证年检中，安全防护措施主要包括 定期组织员工参加安全培训与教育 。具体措施如下：

人员安全培训与教育 ：

安全意识提升培训 ：定期组织员工参加EDI数据安全和网络安全意识培训1。培训内容包括但不限于识别网络钓鱼邮件、防范社会工程学攻击、安全使用办公设备和软件等。

通过这些措施，可以有效提升员工的安全意识，减少因操作不当导致的安全风险，确保EDI系统的稳定运行和数据安全。