申请北京海淀区中关村高新技术企业需要特别注意以下几个问题：

研发人员 ：

企业需要有专职研发人员3人及以上，且研发人员占企业当年职工总数的比例不低于10%。

研发费用 ：

企业上年度研究开发费用支出不低于100万元，且科技活动相关经费支出占企业总收入的比例不低于3%。

产业方向 ：

企业所属行业领域应符合北京市高精尖产业和中关村示范区重点规划的'241+X'产业方向1。'241'指新一代信息技术、生物技术与健康等2个主导产业；先进制造、现代交通、绿色能源与节能环保、新材料等4个重点产业；'X'指培育若干面向未来的战略性产业，包括但不限于类脑智能、量子信息、氢能与储能等方向。

其他要求 ：

企业最近三年的研发费用占销售收入的比例需达到一定标准，具体比例根据企业的销售额类别有所不同。此外，企业需要定期进行年度复审，以维持中关村高新技术企业的资格。

注册地要求 ：

企业必须注册在中关村示范区范围内，并且有实质性研发活动或具有较强科技特色并在主业领域形成较好产出的创新型企业。

中介机构 ：

企业选择中介机构协助申报时，需确保中介机构具有独立执业资格，并在相关领域有丰富的经验，及时与中介机构沟通，明确各自的责任和义务。

政策利用 ：

获得高新技术企业认定的企业，能享受到资金支持，并可能在后续的政策扶持中获得更多优惠。

申报流程 ：

企业需要准备好相关材料，包括企业注册证明、资质证明、产品研发证明等，并填写申请表格。提交申请后，中关村高新技术企业认定机构会对企业进行评审，包括现场考察、资料审核等环节，最终颁发认定证书。

综上所述，申请中关村高新技术企业需要企业在注册地、产业方向、知识产权、研发人员、研发费用、企业类型等方面均需符合相关条件，并且需要认真准备申请材料，并按照要求进行评审和维持资格。选择合适的中介机构协助申报，能够提高申报成功的几率。