北京海淀区股权变更个人所得税申报流程如下：

被投资企业备案

被投资企业登录北京市电子税务局，点击【我要办税】—【其他服务事项】—【其他涉税事项】—【被投资企业董事会 / 股东会报告和个人股东 / 股权变动报告】，填写相关表格进行备案。

转让方提交申请

登录系统：自然人转让方登录自然人电子税务局，点击导航菜单 “我要办税”→“税费申报”→“分类所得申报”→“个人股权转让所得（试点）”，进入 “股权转让资料填报模块”。

填写信息与上传资料：按要求填报各类信息表格，需报送的资料包括：

必填：股权转让合同，合同中应明确转让时间、交易价格、股权数量、股权性质等信息。

选填：资产价值评估报告；其他证明计税依据明显偏低但有正当理由的证明材料；其他相关证明材料。

受让方确认

受让方为自然人：可通过接收短信，在手机 “个人所得税 APP” 收到提醒或电脑登录 “自然人电子税务局（web 端）” 进行股权转让信息确认。

受让方为企业：需登录 “自然人电子税务局（扣缴端）” 或 “自然人电子税务局（web 端）” 扣缴功能进行股权转让信息确认。

主管税务机关受理、审核

税务机关对提交的股权转让信息进行受理、审核。如审核未通过，转让方需按照税务的要求做相应的资料补充或修正。

转让方提交申报

转让方申报缴纳被投资企业主管税务机关审核通过后，自然人转让方登录 “自然人电子税务局（web 端）” 提交申报，完成申报流程。若股权转让资料受理不通过，可以在核实相关信息后重新提交。

获取纳税申报编号

申报完成后，转让方会收到税务发送的短信，包含 “个人股权转让纳税申报编号及相关信息”。