北京昌平公司变更股权时，股东之间可能存在以下权益纠纷：

股东权利纠纷

表决权纠纷：股权变更后，股东的表决权比例发生变化，新老股东可能在公司重大决策上存在分歧，对表决权的行使方式和结果产生争议。

分红权纠纷：公司盈利后，新老股东在分红比例、分红时间等方面存在不同意见，导致分红方案无法通过或实施，影响股东的分红权益。

知情权纠纷：新股东可能认为原股东或公司管理层未充分披露公司信息，影响其对公司经营状况的了解和决策，从而引发知情权纠纷。

债务承担纠纷

隐瞒债务：原股东在转让股权时，故意隐瞒公司的债务情况，受让方在股权变更后才发现，需要承担额外的债务，导致利益受损。

债务分担争议：对于公司已有的债务，新老股东在股权变更时未明确约定分担方式，或者对分担比例存在分歧，在债权人要求偿还债务时，容易引发纠纷。

股东优先购买权纠纷

未通知其他股东：转让方在向股东以外的人转让股权时，未按照法律规定或公司章程的要求，书面通知其他股东，剥夺了其他股东的优先购买权。

同等条件理解分歧：即使通知了其他股东，股东之间对 “同等条件” 的理解可能存在差异，如对价格、支付方式、付款期限等条件的认定不一致，从而引发纠纷。

公司治理结构纠纷

控制权争夺：股权变更可能导致公司控制权发生变化，原控股股东可能不愿意失去控制权，与新股东之间产生争夺，影响公司的决策和运营。

管理层任命争议：新老股东对公司管理层的任命存在不同意见，无法达成共识，导致公司管理混乱，影响公司发展。

股权转让合同纠纷

价格争议：转让方和受让方对股权价格的确定存在分歧，如一方认为应按公司净资产计算，另一方则主张按市场估值计算，导致无法达成一致。

支付方式与时间纠纷：受让方未按照合同约定的支付方式（如分期付款的期数、时间节点）支付股权转让款，或者延迟支付，引发转让方不满。

合同条款履行纠纷：合同中约定的其他条款，如股权交割时间、条件、相关手续办理等，一方未履行或未完全履行，给对方造成损失。

出资纠纷

出资不足或不实：转让方在转让股权时，存在出资不足或出资不实的情况，即非货币财产的实际价额显著低于认缴出资额，受让方在不知情的情况下受让股权后，可能会面临公司或其他股东的追偿。

抽逃出资：转让方在公司成立后抽逃出资，受让方在股权变更后才发现，导致公司资产减少，影响公司正常运营和其他股东权益。