公司申请进出口贸易经营备案时，可能会面临以下问题：

政策法规方面

经营范围不符：企业营业执照上的经营范围未包含 “货物进出口、技术进出口” 等相关表述，需要先进行经营范围变更，才能申请进出口贸易经营备案。

不了解政策变化：国际贸易法规和海关政策可能会随时调整，如果企业不及时关注和了解最新政策，可能导致备案申请不符合新的要求。

流程方面

未按顺序办理：进出口贸易经营备案涉及多个部门和环节，需要按照一定的顺序办理手续，如果企业颠倒顺序或遗漏某些环节，可能会导致备案受阻。

忽视备案变更事项：企业在备案后，如果发生了法定事项（如企业名称变更、注册地址变更等），需要及时办理备案变更手续。如果企业忽视了备案变更事项，将会导致备案信息与实际情况不符，给企业的进出口业务带来隐患。

材料准备方面

材料不齐全：未能按照相关部门要求准备完整的材料，如缺少营业执照副本复印件、组织机构代码证副本复印件（三证合一企业可不提供）、税务登记证副本复印件（三证合一企业可不提供）、法定代表人身份证复印件、公司章程、银行开户许可证复印件等。

材料真实性存疑：提供的材料存在虚假信息，如虚构经营场所、伪造法定代表人身份证明等，一旦被发现，备案申请将被驳回，甚至可能面临处罚。

材料格式不规范：材料的格式和排版不符合要求，如复印件模糊不清、文件未按规定加盖公章等，可能导致材料被退回补充或修改。

备案信息填写方面

基本信息错误：在备案申请表中填写的企业名称、注册地址、经营范围等基本信息与营业执照等证件上的信息不一致，或者填写不规范，如使用简称、错别字等，会导致备案申请被退回。

业务信息不准确：对进出口业务的描述、预计进出口产品或服务的种类和规模等信息填写不准确或不清晰，可能影响相关部门对企业经营能力和业务范围的评估。