如果提交的进出口贸易经营备案申请材料不一致，会产生以下影响：

税务方面

影响出口退税：对于有出口退税需求的企业，备案材料不一致可能导致无法顺利办理出口退税。税务机关在审核退税申请时，会将备案信息与企业申报的退税信息进行比对，若发现不一致，可能会暂扣出口退税款、要求企业补充材料或对企业进行税务稽查等。

面临税务处罚：若税务机关认定企业提交的不一致材料存在故意造假或其他违法违规行为，企业可能会面临罚款等税务处罚，增加企业的税务成本和法律风险。

企业信誉方面

企业信誉受损：频繁因材料不一致导致通关问题或其他业务受阻，会在行业内和合作伙伴间造成不良影响，损害企业的商业信誉和形象，影响企业与供应商、客户的合作关系，降低合作伙伴对企业的信任度，进而可能影响企业未来的业务拓展和市场竞争力。

被列入监管黑名单：如果材料不一致的问题较为严重或多次出现，相关部门可能会将企业列入监管黑名单或失信名单，对企业今后的各类经营活动，包括其他行政审批、招投标等都可能产生负面影响。

审批方面

申请被拒或退回：相关部门会对申请材料进行严格审核，若发现材料不一致，通常会直接拒绝申请或要求企业补充、修正材料后重新提交，导致备案流程受阻，无法顺利获得进出口贸易经营备案资格。

审批时间延长：即使不被直接拒绝，审核人员也需要花费更多时间来核实和确认情况，要求企业做出解释或提供更多证明材料，这会使整个审批周期延长，影响企业开展进出口业务的进度。

通关方面

通关延误：备案信息是海关等部门在货物通关时核对的重要依据，若备案申请材料不一致，海关可能会对贸易的真实性和合法性产生质疑，进而对货物进行更严格的查验等，导致通关时间延长，货物不能及时进出口，可能会给企业带来额外的仓储成本等。

无法通关：在一些严重不一致的情况下，如涉及关键信息的虚假或严重不符，海关可能会禁止货物通关，直到企业解决材料不一致的问题并提供合理的解释和证明。