北京通州区企业预包装食品备案申请的受理部门是通州区市场监督管理局下属的各市场监管所。相关办理时间信息如下：

工作时间：一般是工作日的 9：00-12：00，13：00-18：00。

备案周期：通常情况下，企业在提交完整、规范的申请材料后，审批部门会在一周左右完成审核。

 申请材料
申请预包装食品经营许可证备案时，需要准备以下材料：
（1）《食品经营许可证申请书》；
（2）营业执照复印件；
（3）食品安全管理制度；
（4）相关人员的健康证明和培训证明；
（5）设备设施、场所的卫生条件等情况说明。
办理流程
（1）提交申请：申请人需前往当地市场监督管理局提交申请材料。
（2）现场审查：市场监督管理局将对申请人的经营场所、设备设施、人员等情况进行现场审查。
（3）审批：市场监督管理局将根据审查情况决定是否予以备案，并在规定时间内通知申请人审批结果。
（4）领取备案证明：如果审批通过，申请人可前往市场监督管理局领取备案证明。