网站备案被退回后，可按以下步骤修改并重新提交：

明确退回原因

仔细查看审核部门给出的退回意见，通常退回原因包括资料提交不规范（如未提供原件、资料不全、资料与核验单信息不符等）、信息填写有误（如无效身份证号、地址不详细、电话号码错误等）、域名问题（如域名冲突、域名注册单位和备案单位不同等）、网站问题（如网站运行且有经营性信息、网站信息和备案信息不一致等）以及涉及前置审批项目未审批等。

修改备案信息

补充或更正资料：若因资料不全或不规范被退回，按照要求提供完整、清晰的资料，如营业执照、身份证等尽量提供扫描件，拍照时选择光线好、角度正的位置；认真填写核验单并仔细校对，确保资料与核验单信息一致。

修正信息填写错误：对于无效身份证号、地址不详细、电话号码错误等问题，严格按照相关要求填写准确信息，并设置二次审核机制，保证数据的准确性和真实性。

处理域名问题：如果是域名冲突或域名注册单位和备案单位不同，可更换域名或修改域名注册信息，使其与备案单位一致。

解决网站相关问题：备案审核中网站需关闭，若网站包含经营性信息或者网站信息和备案信息不一致，需进行相应修改，确保网站符合备案要求。

前置审批项目：涉及医疗、教育等必须前置审批的经营项目，需先办理前置审批手续，待审批通过后再提交备案资料。

重新提交备案申请

检查信息准确性：在重新提交前，仔细检查修改后的备案信息和所有补充材料，确保信息准确无误、完整规范，避免出现遗漏、错误或前后矛盾的情况。

提交申请：通过原备案渠道，再次提交修改后的备案信息和材料，并关注申请进度，如有需要，及时配合审核部门的进一步调查和审核工作。