北京朝阳区公司在申请预包装食品备案前，需要做好以下准备工作：

材料准备

基础证明材料：提供有效的营业执照副本原件及复印件，经营范围需包含 “食品经营（仅销售预包装食品）” 等相关表述。提供法人的身份证原件及复印件，复印件需清晰可辨，且与营业执照上的法人信息一致。准备好企业公章，用于在相关申请表格和文件上盖章。

食品相关材料：填写食品经营许可申请书，可从北京市市场监督管理局官网下载或到政务服务大厅领取空白表格。建立完善的食品安全管理制度文件，内容涵盖食品进货查验、储存、销售、卫生管理、人员健康管理等方面。提供企业负责人和食品安全管理人员的食品安全培训合格证明。提供所销售预包装食品的标签和说明书样本，标签应符合《食品安全法》及相关法规要求。提供近期由具备资质的检验机构出具的食品检验报告。提供所销售的预包装食品的产品清单，包括产品名称、规格、生产日期、保质期等信息。签署食品质量安全承诺书，承诺所销售的预包装食品符合相关法律法规要求。

经营场所证明：提供经营场所的租赁合同或产权证明，以及场所的平面图，以证明企业具备符合要求的经营场所。租赁合同的期限应不少于一年，且地址应与营业执照上的地址一致。

其他准备

了解相关法规政策：熟悉《食品安全法》《食品经营许可管理办法》以及北京市关于预包装食品备案的相关政策文件，明确备案的条件、要求和流程。

整理内部管理流程：梳理企业内部的食品采购、储存、销售等环节的管理流程，建立完善的食品追溯体系，实现食品来源可查、去向可追，以便在备案审核及后续经营过程中，能够提供清晰的食品流通信息。

人员准备

配备专业人员：公司应设有专门负责食品安全管理工作的食品安全管理人员，其需熟悉食品安全相关法律法规、标准和规范，具备食品安全管理能力。

组织健康检查：所有直接接触预包装食品的员工，包括销售人员、仓库管理人员等，都要进行健康检查，取得健康证明，且健康证明需在有效期内。

场地与设施准备

确保场地合规：经营场所面积不得少于 20 平方米，仓储、加工区与门店分开，且设有消毒间和洗手间。要保持店内环境干净卫生，窗户和门常关好，通风良好。

准备设施设备：配备与经营的预包装食品品种、数量相适应的货架、货柜等存放设备，根据食品储存要求，配备必要的温度控制、湿度调节等设施，如冷藏柜、除湿机等，以保证食品的储存条件符合要求。