在北京通州区，企业股权变更中印花税的纳税义务发生时间通常为股权转让协议生效且完成股权变更登记之日23。

具体而言，存在以下几种情况：

特殊情况转让：当出现国家有关部门判决、登记或公告生效，或股权被司法或行政机关强制过户、以股权对外投资或进行其他非货币性交易、以股权抵偿债务行为已完成等情形时，纳税义务也随之产生，同样需在次月 15 日内向主管税务机关申报纳税。

正常协议转让：一般以签订的股权转让协议生效，并且受让方已支付或部分支付股权转让价款，或受让方已经实际履行股东职责或者享受股东权益等情况出现时，作为纳税义务发生的标志，进而在次月 15 日内申报缴纳印花税。