出版物许可证年检时对公司财务数据的审计流程如下：

实施审计程序

内部控制测试：评估与财务数据相关的内部控制制度的有效性，如财务审批流程、票据管理制度等。通过询问财务人员、查阅文件记录、实地观察等方式，检查是否存在内部控制漏洞。

形成审计意见并出具审计报告

沟通审计结果：与被审计单位的管理层就审计中发现的问题进行沟通，听取其解释和意见，要求管理层对重大问题提出整改措施。

形成审计意见：根据审计证据和相关审计准则，对公司的财务数据发表审计意见，如无保留意见、保留意见、否定意见或无法表示意见。

撰写并出具审计报告：按照规定的格式和内容要求，撰写审计报告，包括标题、收件人、引言段、管理层对财务报表的责任段、注册会计师的责任段、审计意见段等，加盖会计师事务所公章，由注册会计师签名并盖章后正式出具。

实质性测试

交易及账户余额测试：对出版物销售收入、采购成本等各类交易进行详细检查，核对销售发票、采购合同、出入库单等原始凭证与财务记录是否一致。同时，对库存商品、应收账款、应付账款等账户余额进行函证、盘点等，验证其真实性和准确性。

分析程序：计算与出版物经营相关的财务比率，如毛利率、库存周转率等，对比本期与上期、实际与预算的数据，分析是否存在异常波动。

总结审计证据并编制审计工作底稿

记录审计证据：将审计过程中获取的各种证据，如银行对账单、合同协议、询问笔录等，按照一定的格式和要求进行整理和记录。

编制审计工作底稿：记录审计程序的执行情况、发现的问题、得出的结论等，为编制审计报告提供依据。

前期准备

确定审计目标与范围：明确本次审计是针对出版物许可证年检的财务数据合规性、真实性等进行审计，范围涵盖公司与出版物经营相关的所有财务活动，包括收入、成本、费用等。

组建审计小组：根据审计项目的规模和复杂程度，安排具备相关经验和专业知识的注册会计师及审计助理等人员。

了解被审计单位：收集被审计单位的基本信息，如营业执照、公司章程等，熟悉其经营模式、财务管理制度、内部控制制度等，查阅以往的审计报告等资料。