北京通州区预包装食品备案流程如下：

网上申请

登录北京市企业服务 e 窗通平台，选择食品经营备案（仅销售预包装食品）业务，按系统提示填写《食品经营备案（仅销售预包装食品）信息采集表》，并上传相关材料。

审核与备案

相关部门对提交的材料进行审核，如有问题会反馈给企业，企业需根据反馈意见进行整改并重新提交。审核通过后，企业将完成备案。

备案信息表领取

备案完成后，备案申请人可登录 “北京市市场监督管理局网上政务服务平台”，在 “我的业务” 菜单自行下载、打印、使用《仅销售预包装食品经营者备案信息表》。

备案前准备

确认经营范围：若企业新设立，在申请营业执照设立登记时，经营范围选择 “食品销售（仅销售预包装食品）”，拟销售特殊食品的，还需选择 “保健食品（预包装）销售” 等相应项目；已取得营业执照的企业，办理经营范围变更登记，增加上述对应经营范围。

准备人员材料：配备食品安全管理人员，提供其培训合格证明，从业人员需持有有效的健康证。

准备其他材料：准备企业营业执照、公章、法人身份证复印件、法人手机号码及身份证号码、预包装食品备案表、食品经营备案（仅销售预包装食品）信息采集表等材料。