公司的 EDI 许可证年报审核不通过的情况有很多，主要包括企业基本信息问题、人员及社保问题、业务运营问题、财务数据问题等，以下是具体介绍：

业务运营问题

网站建设不完善：采用第三方商家入驻电商模式的网站，交易功能不完善，没有商品展示、下单支付等全流程交易闭环；无可靠的用户信息保护机制；数据处理能力差，无法快速准确处理商品数据、交易订单数据；网站域名未备案或所有权不属于申请公司。

业务范畴及合规性问题：实际开展的业务与 EDI 许可证所涵盖的业务范围不一致，或涉及新闻、出版等特殊行业服务却未取得相关主管部门的前置审批文件；业务模式不清晰，无法清晰说明盈利模式、交易流程等。

违法违规记录：企业及其主要出资者和主要经营管理人员三年内存在违反电信监督管理制度的违法记录，或存在其他违法违规经营行为。

年报材料问题

申请表填写问题：申请表中的企业信息、联系人信息、业务信息等填写不准确、不完整，如业务发展和实施计划表述不清、盈利模式填写错误等。

材料缺失或不合规：申请材料有遗漏、不清晰、无法证明其真实性等，如未提供营业执照副本、法人及股东身份证明等支持性文件。

财务数据问题

数据填写错误：将非 EDI 业务相关收入计入 EDI 业务收入，或未准确区分 EDI 业务成本和其他业务成本，造成 EDI 业务利润计算偏差。

数据不一致：财务报表中的数据与其他文档或说明中的数据不一致，降低了年检材料的可信度。

遗漏重要数据：忘记填写纳税总额、应收账款等与 EDI 业务资金流动密切相关的数据，使财务报表不完整。

企业基本信息问题

企业性质不符：企业不是依法成立的内资公司，或存在外资成分，违反 EDI 许可证内资要求。

营业执照异常：营业执照不在有效期内，或经营范围未明确包含 “增值电信业务” 字样。

注册资本问题：在省、自治区、直辖市范围内经营的，注册资本低于 100 万元人民币；在全国或者跨省、自治区、直辖市范围经营的，注册资本低于 1000 万元人民币，或者注册资本未足额到位，资金证明材料不规范。

人员及社保问题

人员数量不足：未达到部分地区要求的至少三名员工参保的标准。

专业人员缺失：企业团队中缺乏计算机等相关专业人员，无法满足 EDI 业务的技术需求。

社保缴纳不合规：社保证明存在虚假、缴纳时间不足等问题。