北京丰台区食品企业申请预包装食品备案需要准备的材料如下：

食品安全制度文件

食品安全管理制度文件，包括食品安全自查制度、进货查验记录制度、从业人员健康管理制度等。

预包装食品相关材料

所销售的预包装食品的产品清单，包括产品名称、规格、生产日期、保质期等信息。

预包装食品的标签样本。

签署食品质量安全承诺书，承诺所销售的预包装食品符合相关法律法规要求。

基础材料

填写完整的预包装备案申请表。

有效的企业营业执照原件及复印件。

企业法定代表人身份证复印件。

人员证明

食品安全管理人员的培训合格证明。