‌真空包装的食品商家是否都进行了食品预包装备案，取决于具体情况。‌

根据《中华人民共和国食品安全法》的规定，仅销售预包装食品的商家不需要取得食品生产经营许可，但需要向所在地县级以上地方人民政府食品安全监督管理部门备案。这意味着，如果商家只是销售预包装食品，包括真空包装的食品，他们需要按照规定进行备案登记‌。

备案的具体流程包括向当地食品安全监督管理部门提交备案申请，并提供相关资料，如企业营业执照、法定代表人身份证明、预包装食品的相关信息等。提交资料后，食品安全监督管理部门会进行审核，审核通过后即可完成备案登记‌。

此外，真空包装作为预包装食品的一种包装形式，其包装上应当符合《中华人民共和国食品安全法》第六十七条的规定，有完整的标签，并标明名称、规格、净含量、生产日期、成分或配料表、生产者的名称、地址、联系方式、保质期等信息。这些标签信息可以视为真空包装食品的一种“证明”，证明其合法性、安全性及来源等‌。