公司内部出现以下问题会影响进出口贸易经营备案申请：

财务状况方面

财务状况不佳：资产负债率过高，表明企业长期偿债能力较弱，可能无法承担进出口业务中的风险和费用；或者存在严重亏损，显示企业盈利能力不足，会使审批部门认为企业开展进出口业务的稳定性和可持续性存在问题。

税务问题：有欠税、偷逃税等税务违法违规记录，税务部门会将相关信息反馈给备案审批部门，影响备案申请的审批结果。

经营范围与资质方面

经营范围不符：营业执照上的经营范围没有包含 “货物进出口”“技术进出口” 等相关表述，且未及时办理工商变更增加相关经营范围，无法申请进出口贸易经营备案。

相关资质欠缺：若从事特定商品的进出口，如食品、医疗器械等，未取得相应的生产许可证、经营许可证等前置审批资质，会导致备案申请不通过。

材料准备与信息方面

申请材料不全或不实：如未提供完整的营业执照副本、法定代表人身份证明、公司章程等基本材料，或提供虚假的财务报表、经营场所证明等，会导致申请不通过。

备案信息填写错误：在备案申请表中，企业名称、注册地址、经营范围、联系电话等信息填写有误或与实际情况不符，可能使备案申请被退回。

企业经营与管理方面

经营异常：被列入经营异常名录，如存在未按时公示年度报告、通过登记的住所或经营场所无法联系、公示企业信息隐瞒真实情况、弄虚作假等情况，相关部门可能对其进出口贸易经营备案申请持谨慎态度或不予批准。

无固定经营场所：没有稳定、合法的经营场所，无法为进出口业务提供必要的办公、仓储等条件，不符合备案要求。

专业人员缺乏：未配备熟悉进出口业务流程、国际贸易规则和相关法律法规的专业人员，无法有效开展进出口贸易活动，可能影响备案申请。

内部管理混乱：没有建立完善的内部管理制度，如报关流程、货物收发管理、财务核算等制度缺失或执行不力，会让审批部门对企业的运营能力和合规性产生质疑。