申请北京海淀区中关村高新技术企业认定的流程如下：

认定、公示与备案

认定：认定机构根据专家评审意见和现场考察情况，对企业进行认定。

公示：经认定的高新技术企业在 “高新技术企业认定管理工作网” 上公示 15 个工作日。

备案：公示无异议的，报送领导小组办公室备案，在 “高新技术企业认定管理工作网” 上公告认定结果，并向企业颁发统一印制的 “高新技术企业证书”。

后续事项

证书领取：企业按照通知要求，携带相关材料到指定地点领取高新技术企业证书。

年报填报：企业在获得高新技术企业资格后，应在每年 3 月 31 日前填报火炬统计调查，于每年 5 月 31 日前提交年度发展情况报表。

前期准备

企业自评：企业依据《高新技术企业认定管理办法》和《高新技术企业认定管理工作指引》，对技术创新能力、研发投入、知识产权情况、科技人员占比、高新技术产品（服务）收入占比等进行自我评价。

条件确认：确认注册地址在中关村科技园区内，主营业务属于高新技术领域。

材料准备：准备企业注册证明、资质证明、知识产权证明、产品研发证明等必要证明材料。

在线申报

系统登录：登录 “高新技术企业认定管理工作网”或北京市指定的在线平台，如国际科技创新中心网站或市科委网站

填写申请：按要求填写《高新技术企业认定申请书》，选择入库方式及申报类型。

上传材料：上传知识产权证书、经具有资质的中介机构鉴证的企业近三个会计年度的财务会计报告等相关电子材料。

提交纸质材料：将纸质申报材料报送到海淀区科委、中关村示范区各分园区管委会等受理部门。

形式审查

受理部门收到申报材料后，对材料的完整性和合规性进行审查，检查材料是否齐全、填写是否规范、相关证明文件是否有效等。

评审与考察

专家评审：认定机构建立高新技术企业认定评审专家库，抽取专家对申报企业进行审查，提出认定意见。

现场考察：可能会对企业进行现场考察，核实企业实际情况与申报材料是否一致，包括查看企业的研发场地、设备设施、研发人员工作情况等。