针对知识产权问题

专利证书或软件著作权证书

如果之前是因为知识产权数量不足而被驳回，需要补充新的专利或软件著作权。例如，企业应努力获取至少 1 项发明专利或 3 项实用新型专利；或者拥有 5 项以上软件著作权等核心自主知识产权。

若是知识产权的关联性不强，需要重新梳理并提供与企业主要产品或服务紧密相关的知识产权证明，比如详细说明专利技术如何应用在产品的核心功能中。

知识产权变更证明（如有）

若企业知识产权发生转移或变更，需要提供完整的变更证明文件，包括转让合同、著录项目变更通知书等，以证明知识产权的合法性和所属权。

财务问题

研发费用核算不准确

企业在研发费用核算方面存在困难，难以准确划分研发费用和其他费用。例如，一些企业可能将生产经营活动中的部分费用误计入研发费用，或者将部分研发人员的非研发工作时间对应的费用也计入研发费用，导致研发费用核算不精准。

研发费用的归集范围不明确。不同企业对研发费用的理解存在差异，可能导致部分符合要求的费用没有被计入，或者不符合要求的费用被错误计入，从而影响研发费用占比是否符合高新技术企业的标准。

研发组织管理

研发管理制度不完善

部分企业的研发管理制度存在漏洞。例如，没有建立完善的研发项目立项、过程管理和验收制度，导致研发过程缺乏有效监控，研发成果质量和转化效率低下。

研发人员绩效考核制度不合理，无法有效激励研发人员的创新积极性，可能导致研发人员动力不足，影响企业的技术创新能力。