1、著作权保护的软件包括两部分，即计算机程序和文档。
2、计算机程序是指为了得到某种结果而可以由计算机等具有信息处理能力的装置执行的代码化指令序列或者可以被自动转换成代码化指令序列的符号化指令序列或者符号化语句序列。程序包括使用程序语言编写的源程序和使用机器语言编写的目标程序。同一计算机程序的源程序和目标程序为同一作品。文档是指用来描述程序的内容、组成、设计、功能规格、开发情况、测试结果使用方法的文字资料和图表等，如程序设计说明书、流程图、用户手册等。

在申请过程中，需要注意以下几点：

‌申请人资格‌：申请人必须是该软件的著作权人，或者是通过继承、受让等方式取得权利的自然人、法人或其他组织。

‌材料准备‌：提交的材料应包括软件源代码、文档说明、申请人身份证明等，确保材料的真实性和完整性。

‌合规性‌：确保软件符合著作权法的规定，避免侵犯他人权益。

通过以上步骤和注意事项，可以顺利完成计算机软件著作权的申请，保护自己的软件作品。